აშშ-ს დაავადებათა კონტროლისა და პრევენციის ცენტრმა, CDC, წამოიწყო კონსორციუმი, რათა დაეწყო თანმიმდევრობის ლაბორატორიების ეროვნული ქსელი, რომელიც დააჩქარებს SARS-CoV-2 თანმიმდევრობის მონაცემების საჯარო დომენში გამოქვეყნებას. ღია კორონავირუსის თანმიმდევრობის მონაცემების სწრაფი გამოშვება დაგეხმარებათ COVID-19 საზოგადოებრივი ჯანდაცვის რეაგირება, ინოვაციებისა და აღმოჩენების გააქტიურება და ამ და მომავალი პანდემიების წინასწარ გაგება.
ეს SARS-CoV-2 თანმიმდევრობა საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის გადაუდებელ სიტუაციებზე რეაგირებისთვის, ეპიდემიოლოგიისა და ზედამხედველობისთვის (SPHERES) კონსორციუმი, რომელიც მნიშვნელოვნად გააფართოვებს გამოყენებას მთელი გენომის თანმიმდევრობა (WGS) COVID-19 ვირუსის. SPHERES მიაწვდის თანმიმდევრულ, რეალურ დროში თანმიმდევრულ მონაცემებს საზოგადოებრივი ჯანდაცვის რეაგირების გუნდებს, რომლებიც იკვლევენ COVID-19-ის შემთხვევებს და კლასტერებს მთელი ქვეყნის მასშტაბით.
ეს ახალი კონსორციუმი დაეხმარება მათ უკეთ გაიგონ, თუ როგორ ვრცელდება ვირუსი, როგორც ეროვნულ, ისე ადგილობრივ თემებში. უკეთესი მონაცემები, თავის მხრივ, დაეხმარება საზოგადოებრივი ჯანდაცვის წარმომადგენლებს შეწყვიტონ გადაცემის ჯაჭვები, თავიდან აიცილონ ავადმყოფობის ახალი შემთხვევები და დაიცვან და გადაარჩინონ სიცოცხლე.
„აშშ არის მსოფლიოში ლიდერი გენომის მოწინავე სწრაფი სწრაფი თანმიმდევრობით. ეს კოორდინირებული ძალისხმევა ჩვენს საჯარო, კერძო, კლინიკურ და აკადემიურ საზოგადოებრივ ჯანდაცვის ლაბორატორიებში გადამწყვეტ როლს ითამაშებს SARS-CoV-2-ის გადაცემის, ევოლუციისა და მკურნალობის გაგებაში. დარწმუნებული ვარ, რომ ჩვენი საუკეთესო, ყველაზე გამოცდილი გონები ერთად მუშაობენ, რათა დაგვეხმარონ გადავარჩინოთ სიცოცხლე დღეს და ხვალ“, - თქვა CDC-ის დირექტორმა რობერტ რედფილდმა, მედიცინის დოქტორი.
COVID-19 ვირუსის განვითარებაზე თვალყურის დევნება
გენომიური თანმიმდევრობის მონაცემებმა შეიძლება მოგვცეს უპრეცედენტო ხედვა SARS-CoV-2-ის, ვირუსის ბიოლოგიის შესახებ, რომელიც იწვევს COVID-19-ს, და დაგვეხმაროს პანდემიის ცვალებადი ლანდშაფტის განსაზღვრაში. ვირუსების თანმიმდევრობით შეერთებული შტატებიდან, CDC და სხვა საზოგადოებრივი ჯანდაცვის ორგანოებს შეუძლიათ ვირუსის მნიშვნელოვანი ცვლილებების მონიტორინგი და გამოიყენონ ეს ინფორმაცია კონტაქტის კვალიფიკაციის, საზოგადოებრივი ჯანმრთელობის შერბილების მცდელობებისა და ინფექციის კონტროლის სტრატეგიების უხელმძღვანელებისთვის.
SPHERES კონსორციუმი არის ამბიციური მცდელობა SARS-CoV-2 გენომის თანმიმდევრობის ეროვნულ დონეზე კოორდინაციისთვის, აწყობს ათობით პატარა, ინდივიდუალურ ძალისხმევას ლაბორატორიების, ინსტიტუტებისა და კორპორაციების ერთიან, განაწილებულ ქსელში. კონსორციუმი აერთიანებს 40 სახელმწიფო და ადგილობრივი საზოგადოებრივი ჯანდაცვის დეპარტამენტის გამოცდილებას, ტექნოლოგიას და რესურსებს, რამდენიმე დიდ კლინიკურ ლაბორატორიას და ორ ათზე მეტ თანამშრომლობას ფედერალურ მთავრობაში, აკადემიასა და კერძო სექტორში.
SPHERES დაამყარებს საუკეთესო პრაქტიკას და მონაცემთა კონსენსუსის სტანდარტებს, დააჩქარებს ღია მონაცემთა გაზიარებას და შექმნის რესურსებისა და ექსპერტიზის აუზს, რათა დაეხმაროს უახლესი ტექნოლოგიების მიტანას COVID-19-ის ეროვნულ პასუხში.
SPHERES მონაცემები ღიაა, გაზიარებული
კონსორციუმის წევრები იზიარებენ ვალდებულებას სწრაფი ღია მიმდევრობის გაზიარების შესახებ. ისინი გეგმავენ ყველა სასარგებლო თანმიმდევრობის მონაცემის წარდგენას საჯარო საცავებში მედიცინის ეროვნული ბიბლიოთეკის ბიოტექნოლოგიური ინფორმაციის ეროვნულ ცენტრში (NLM/NCBI), ფრინველის გრიპის მონაცემების გაზიარების გლობალურ ინიციატივას (GISAID) და სხვა საჯარო თანმიმდევრობის საცავებში. ეს ხელს შეუწყობს იმის უზრუნველყოფას, რომ ვირუსული თანმიმდევრობის მონაცემები შეერთებული შტატების მასშტაბით არის სწრაფად ხელმისაწვდომი საზოგადოებრივი ჯანდაცვის გადაწყვეტილების მისაღებად და თავისუფლად ხელმისაწვდომი მკვლევრებისთვის ყველგან.
კონსორციუმის წევრები არიან:
ფედერალური სააგენტოები და ლაბორატორიები
დაავადებათა კონტროლისა და პრევენციის ცენტრები, მოწინავე მოლეკულური გამოვლენის ოფისი
Argonne ეროვნული ლაბორატორია
თავდაცვის ჯანდაცვის სააგენტო, გლობალური ინფექციური დაავადება დაკვირვება
სურსათისა და წამლის ადმინისტრაციის
ლოურენს ბერკლის ეროვნული ლაბორატორია
Los Alamos ეროვნული ლაბორატორია
ალერგიისა და ინფექციური დაავადებების ეროვნული ინსტიტუტი, გენომიკისა და მოწინავე ტექნოლოგიების ოფისი
სტანდარტებისა და ტექნოლოგიების ეროვნული ინსტიტუტი
მედიცინის ეროვნული ბიბლიოთეკა ბიოტექნოლოგიის ინფორმაციის ეროვნული ცენტრი
უოლტერ რიდის არმიის კვლევის ინსტიტუტი
სახელმწიფო/ადგილობრივი საზოგადოებრივი ჯანდაცვის ლაბორატორიები
Arizona
კალიფორნიის
Delaware
District of Columbia
Florida
Hawaii
Maine
მერილენდის
მასაჩუსეტსი
მიჩიგანის
მინესოტა
ჩრდილოეთ კაროლინას
ჩრდილოეთ დაკოტა
ნევადა
ახალი მექსიკაში
ნიუ იორკი
იუტა
Virginia
ვაშინგტონი
Wisconsin
ვაიომინგი
აკადემიური ინსტიტუტები
Baylor უნივერსიტეტის
კორნელის უნივერსიტეტში
Fred Hutchinson კიბოს კვლევის ცენტრი
სინას მთის მედიცინის სკოლა
ნიუ იორკის უნივერსიტეტის
ჩრდილოეთ Arizona უნივერსიტეტი
ბუფალოს უნივერსიტეტი
კალიფორნიის უნივერსიტეტის, ბერკლი
კალიფორნიის უნივერსიტეტი, დევისი
კალიფორნიის უნივერსიტეტის, Irvine
კალიფორნიის უნივერსიტეტის, Los Angeles
კალიფორნიის უნივერსიტეტის, San Francisco
კალიფორნიის უნივერსიტეტი, სანტა კრუზი
ჩიკაგოს უნივერსიტეტის
მერილენდის უნივერსიტეტის
უნივერსიტეტის Minnesota
ნებრასკის უნივერსიტეტი
უნივერსიტეტის ახალი მექსიკა
ვაშინგტონის უნივერსიტეტი
იელის უნივერსიტეტი
კორპორაციები
ებოტის დიაგნოსტიკა
bioMerieux
ფერთა გენომიკა
Gingko Bioworks
IDbyDNA
ინ – q – ტელ
ლაკორპი
ერთი კოდექსი
ოქსფორდის ნანოპორის ტექნოლოგიები
წყნარი ოკეანე ბიოლოგია
Qiagen
ძებნა დიაგნოსტიკა
ნამდვილად სიცოცხლის შემსწავლელი მეცნიერებები
კორპორაციების სახელები მოწოდებულია მხოლოდ საინფორმაციო მიზნებისთვის და მათი აქ ჩართვა არ წარმოადგენს აშშ-ს დაავადებათა კონტროლისა და პრევენციის ცენტრების მიერ კორპორაციების ან მათი კომერციული პროდუქტებისა თუ მომსახურების მოწონებას.
არაკომერციული საზოგადოებრივი ჯანდაცვის ან კვლევითი ინსტიტუტები
საზოგადოებრივი ჯანდაცვის ლაბორატორიების ასოციაცია
ბილ და მელინდა გეითსი ფონდი
ფართო ინსტიტუტი
ჩან ცუკერბერგი BioHub
კრეიგ ვენტერის ინსტიტუტი
საზოგადოებრივი ჯანდაცვის ალიანსი გენომიური ეპიდემიოლოგიისთვის
სკრიპსის კვლევა
ჯექსონის ლაბორატორია
თარგმანის გენომიკის კვლევითი ინსტიტუტი – ჩრდ
ვალდერის ფონდი
გასული ექვსი წლის განმავლობაში, CDC-ის გაფართოებული მოლეკულური გამოვლენის ოფისმა ინვესტიცია მოახდინა ფედერალურ და სახელმწიფო საზოგადოებრივი ჯანდაცვის ლაბორატორიებში, რათა გააფართოვოს პათოგენის გენომიკის და სხვა მოწინავე ლაბორატორიული ტექნოლოგიების გამოყენება ინფექციურ დაავადებათა მეთვალყურეობისთვის და ეპიდემიაზე რეაგირებისთვის. მიმდინარე კონსორციუმის ინვესტიცია მიზნად ისახავს სიცოცხლის გადარჩენას SARS-CoV-2 პანდემიის დროს და მოამზადოს შეერთებული შტატები და მსოფლიო მომავალი პანდემიის რეაგირებისთვის.
გენომიური თანმიმდევრობის ან CDC-ის მუშაობის შესახებ გაფართოებული მოლეკულური გამოვლენის შესახებ, ეწვიეთ https://www.cdc.gov/amd/
